دیدار آرسنال در مقابل اورتون - 1905 در زمین پلام استید
در سال 1891 باشگاه حرفه ای شد. و نام خود را به وولویچ آرسنال تغییر داد.
کمیته محلی فوتبال لندن تلاش کرد سایر باشگاه های لندنی مانند تاتنهام (Tottenham)، کوئینز پارک رنجرز (Queen's Park Rangers) و میلوال (Millwall) را متقاعد کند تا یک لیگ جنوبی تشکیل دهند اما این پیشنهاد پذیرفته نشد، بنابراین وولویچ آرسنال به لیگ فوتبال انگلستان درخواستی داد در سال 1893 در لیگ دسته دو پذیرفته شد.
در آن زمان آن ها تنها تیم حرفه ای لندن بودند و اولین باشگاه در جنوب شهر بیرمنگام سیتی بودند که در لیگ پذیرفته شدند.
همان سال وولویچ آرسنال به زمین مینور (Manor) بازگشت، اولین زمینی که سکوهایی بزرگ با کناره ای پُرشیب داشت و به اصطلاح اسپیون کپ (Spion Kop) شناخته می شد که برگرفته از نام سربازانی بود که از جنگ بوار (Boer) باز می گشتند. بنابراین کوپ (Kop) اصلی به وولویچ آرسنال تعلق داشت.
اولین بازی آن ها در لیگ، روز شنبه دوم سپتامبر همان سال در مقابل دیگر باشگاهی که اتفاقاً آن هم به تازگی به لیگ ملحق شده بود برگزار شد، نام آن تیم نیوکاسل یونایتد (Newcastle United) بود. این بازی در زمین مینور انجام شد و با دو گلی که شاو (Shaw) و الیوت (Elliott) برای توچی ها به ثمر رساندند، حساب کار 2-2 خاتمه یافت.
یک هفته بعد وولویچ آرسنال متحمل اولین شکست خود در لیگ شد. توپچی ها با نتیجه 3-2 بازی را به نوتس کانتی (Notts County) واگذار کردند. دو روز بعد اولین پیروزی باشگاه در لیگ شکل گرفت، در روزی که جان هیث (John Heath) با زدن سه گل توانست هت تریک کند، آرسنال با نتیجه 4-0 والسال (Walsall) را درهم کوبید.
در اولین فصل حضور توپچی ها در لیگ، نیوکاسل یونایتد در خانه خود 6-0 وولویچ آرسنال را مغلوب کرد و برتون سویفتز (Burton Swifts) نیز در خانه خود 6-2 آرسنال را شکست داد اما قرمزپوشان با دو پیروزی 3-6 در خانه میدلزبرو آیرونوپلیس (Middlesbrough Ironopolis) و 6-0 در خانه خود مقابل نوریچ ویکتوریا (Northwich Victoria)، آن دو شکست را جبران کردند.
وولویچ آرسنال پیروزی جانانه ای را را در چهاردهم اکتبر 1893 رقم زد. توپچی ها موفق شدند در جام حذفی، آشفورد یونایتد (Ashford United) را با نتیجه 12-0 شکست دهند. این پیروزی برزرگترین برد تیم در رقابت های قدیمی شناخته شده است.
وولویچ آرسنال در اولین فصل حضور خود در لیگ، در جدول 15 تیمی بازی ها، با کسب 28 امتیاز از 28 بازی در مکان نهم جای گرفت، عملکردی آبرومندانه که نقطه عطفی در شروع مبارزات باشگاه محسوب می شد.