یانکولوفسکی پس از فتح سری آ به همراه میلان، از این تیم جدا شد. او به عنوان بازیکن آزاد به تیم دوران کودکی اش در جمهوری چک بازگشت. متاسفانه شرایط برای این بازیکن خوب پیش نرفت و یانکولوفسکی به دلیل مصدومیت شدید از ناحیه زانو، مجبور به خداحافظی از دنیای فوتبال شد. این بازیکن در مجموع 153 بار برای میلان به میدان رفت.
